L'Area marina protetta interessa l'area costiera che circonda le isole di S. Domino, S. Nicola, Caprara e Pianosa per tutto il tratto di mare ricompreso, in via di massima, fino all'isobata dei 70 metri e secondo quanto puntualmente indicato, nella cartografia riportata in questo sito ed allegata al decreto istitutivo, con i numeri I e II. L'area protetta Isole Tremiti è delimitata, nel mare circostante l'arcipelago delle isole Tremiti, dalla congiungente i seguenti punti:

II.

nonché, nel mare circostante l'isola di Pianosa, dalla congiungente i seguenti punti:

I.

	Latitudine	Longitudine
A)	42° 13' 42'' N	015° 44' 30'' E
B)	42° 13' 36'' N	015° 45' 20'' E
C)	42° 12' 54'' N	015° 45' 00'' E
D)	42° 13' 00'' N	015° 44' 12'' E
E)	42° 13' 30'' N	015° 44' 00'' E

La zona A di riserva integrale comprende il tratto di mare che circonda l'isola di Pianosa delimitato dai punti da A) ad E), come sopra individuati ed indicati nella cartografia riportata in questo sito ed allegata al decreto istitutivo, sotto il numero I), secondo una linea ideale di confine che, per quanto possibile, segue l'isobata dei 70 metri.

I.

Sono vietate:
l’asportazione anche parziale e il danneggiamento delle formazioni geologiche e minerali;
la balneazione nonché la navigazione, l’accesso e la sosta, con navi e natanti di qualsiasi genere e tipo, ad eccezione di quelli autorizzati dall’ente gestore, per finalità scientifiche e per visite guidate;
la pesca sia professionale che sportiva con qualunque mezzo esercitata;
la caccia, la cattura , la raccolta, il danneggiamento, e in genere qualunque attività che possa costituire pericolo o turbamento delle specie animali e vegetali, ivi compresa l’immissione di specie estranee;
l’alterazione con qualsiasi mezzo, diretta o indiretta, dell’ambiente geofisico e delle caratteristiche biochimiche dell’acqua, nonché la discarica dei rifiuti solidi o liquidi e in genere l’immissione di qualsiasi sostanza che possa modificare, anche transitoriamente, le caratteristiche dell’ambiente marino;
l’introduzione di armi, esplosivi e di qualsiasi mezzo distruttivo o di cattura, nonché di sostanze tossiche o inquinanti;
le attività che possono comunque arrecare danno, intralcio o turbativa ai programmi di studio e di ricerca scientifica da attuarsi sull’area;
l’immersione con o senza apparecchio di respirazione, ad eccezione di quelle autorizzate dall’ente gestore.

Le zone B di riserva generale dell'area protetta sono due e comprendono, all'interno di una linea ideale di confine che, per quanto possibile, segue l'isobata dei 70 metri, secondo quanto indicato sotto il numero II) nella cartografia riportata in questo sito ed allegata al decreto ministeriale:

1. la zona di mare dell'isola di Caprara che comprende la parte costiera dell'isola di Caprara, da Cala Sorrentino allo scoglio Caciocavallo verso l'esterno dell'arcipelago, delimitata dalla congiungente i seguenti punti:

2. la zona di mare dell'isola di S. Domino compresa tra il faro di Punta Provvidenza e Punta Secca, delimitata dalla congiungente i seguenti punti:

Sono vietate:
qualsiasi forma di pesca e di prelievo da pare dei subacquei muniti o meno di apparecchi respiratori;
qualsiasi forma di pesca sportiva o professionale che non sia stata previamente autorizzata dall’ente di gestione della riserva;
la navigazione tranne quella autorizzata dall’ente gestore;
qualsiasi attività che possa alterare direttamente o indirettamente l’ambiente geofisico o possa comunque arrecare danno all’ambiente.
In detta zona l’autorità di gestione della riserva può autorizzare attività di pesca professionale o sportiva esercitata unicamente con lenze da fermo o da traino nonché immersioni e attività fotografica subacquea.

La zona C di riserva parziale comprende il tratto di mare circondante l'isola di S. Nicola, l'isola di S. Domino e l'isola di Caprara, escludendo le due zone B, all'interno di una linea ideale di confine che per quanto possibile segue l'isobata dei 70 metri, ed è delimitata dalla congiungente i seguenti punti:

In tale zona è vietata qualsiasi forma di pesca professionale che non sia stata previamente autorizzata dall’ente gestore della riserva. E’ ammessa qualsiasi forma di pesca sportiva, nei limiti consentiti dalla vigente legislazione, salvo la facoltà dell’ente di gestione della riserva di prevedere limiti più restrittivi volti esclusivamente alla tutela ed all’incremento delle risorse biologiche.